Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpa6Q5U901 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpa6Q5U901 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms