Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms