Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SynrgQ5SV85 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SynrgQ5SV85 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms