Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp18Q5SSI6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp18Q5SSI6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms