Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sun3Q5SS91 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms