Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc85aQ5SP85 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms