Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Bhlha9Q5RJB0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms