Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spata48Q5NC83 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata48Q5NC83 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms