Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SynaQ5G5D5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms