Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Urb1Q571H0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms