Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf608Q56A10 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf608Q56A10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf608Q56A10 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Znf608Q56A10 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf608Q56A10 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf608Q56A10 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf608Q56A10 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf608Q56A10 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf608Q56A10 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf608Q56A10 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf608Q56A10 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms