Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc47Q505F5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms