Protein–RNA interactions for Protein: Q4QRL3

Ccdc88b, Coiled-coil domain-containing protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88bQ4QRL3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc88bQ4QRL3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc88bQ4QRL3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms