Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Garnl3Q3V0G7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms