Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms