Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5aQ3UXZ9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5aQ3UXZ9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5aQ3UXZ9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5aQ3UXZ9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kdm5aQ3UXZ9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm5aQ3UXZ9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
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