Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf223Q3UV31 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf223Q3UV31 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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