Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TceancQ3US16 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TceancQ3US16 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms