Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa5b2Q3UR50 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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