Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrch2Q3UMG5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms