Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin1rt1Q3ULQ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms