Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LchnQ3UHG7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms