Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pitpnm3Q3UHE1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms