Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plxnd1Q3UH93 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plxnd1Q3UH93 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms