Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc58Q3UGP9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc58Q3UGP9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms