Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem35bQ3U0Y2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms