Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms