Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl4Q3TZA2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms