Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms