Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TchpQ3TVW5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TchpQ3TVW5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms