Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21440Q3TTD8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm21440Q3TTD8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Gm21440Q3TTD8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm21440Q3TTD8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm21440Q3TTD8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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