Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pde12Q3TIU4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pde12Q3TIU4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pde12Q3TIU4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms