Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc13Q3TIR1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Trappc13Q3TIR1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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