Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3KNL4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3KNL4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms