Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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