Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ptcd3Q14C51 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms