Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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VgfQ0VGU4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms