Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rundc1Q0VDN7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms