Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc45a4Q0P5V9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc45a4Q0P5V9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms