Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spata18Q0P557 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spata18Q0P557 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms