Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc7a1Q09143 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc7a1Q09143 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms