Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pate4Q09098 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms