Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700061G19RikQ08EE8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700061G19RikQ08EE8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms