Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc4Q08624 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc4Q08624 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms