Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SctQ08535 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SctQ08535 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SctQ08535 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms