Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Col9a2Q07643 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms