Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Siah1bQ06985 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms