Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mex3cQ05A36 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms