Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr5Q04683 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms