Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kcnb1Q03717 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms